Fafo har ansvar for driften og den faglige utviklingen av forumet. Det innebærer å drifte nettsiden, lage nyhetsbrev og faktaflak, og arrangere seminarer og workshops.

Vinkling og prioritering av problemstillinger skjer i samarbeid med referansegruppen. Fafo Østforums referansegruppe består av én representant fra hver av de 22 deltakerne.

Aktivitetene finansieres gjennom en deltakeravgift på kr. 50 000 (i 2024).